当系统启动时, BIOS 从第一个磁碟(或从软碟)读取磁区 0 (一般通称的 MBR - Master Boot Record, 主启动磁区)并跳至在该处的程式码 - 通常是一些启动载入程式(bootstrap loader)． 这些小小的启动程式一般不会有自己的磁碟驱动程式而会使用 BIOS 所提供的服务．这意谓著只有整个 Linux 核心都位於开头的 1024 个磁簇内时才能够被启动．
这个问题很容易解决: 确定核心(也许还包括其它启动时用到的档案, 像是 LILO map 档) 是放在一个 BIOS 可以存取的到, 全都在开头的 1024 个磁簇内的分割区里 - 这可以(可能)是第一个或第二个磁碟．
另一点是启动载入程式与 BIOS 必须同意彼此对磁碟逻辑(geometry)上的看法．
给 LILO `linear' 这个选项参数可能会有些帮助．细节後述．